Protein–RNA interactions for Protein: O95777

LSM8, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM8O95777 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM8O95777 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSM8O95777 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM8O95777 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSM8O95777 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM8O95777 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM8O95777 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM8O95777 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms