Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
POLR1AO95602 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
POLR1AO95602 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms