Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC24BO95487 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms