Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEBLO76041 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEBLO76041 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEBLO76041 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEBLO76041 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEBLO76041 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEBLO76041 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEBLO76041 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms