Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KA4O75676 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms