Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR5O60602 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR5O60602 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR5O60602 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR5O60602 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR5O60602 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLR5O60602 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR5O60602 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR5O60602 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR5O60602 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms