Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREM1O60565 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GREM1O60565 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREM1O60565 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREM1O60565 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREM1O60565 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREM1O60565 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GREM1O60565 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GREM1O60565 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GREM1O60565 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GREM1O60565 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms