Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLC25A20O43772 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms