Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAB2O43741 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms