Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYTH3O43739 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYTH3O43739 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms