Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3O43617 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms