Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMM44O43615 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM44O43615 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms