Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYT7O43581 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT7O43581 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT7O43581 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYT7O43581 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT7O43581 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT7O43581 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT7O43581 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms