Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD51CO43502 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD51CO43502 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms