Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNAB3O43448 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNAB3O43448 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.7 ms