Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMC8O43402 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC8O43402 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC8O43402 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC8O43402 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC8O43402 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC8O43402 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC8O43402 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms