Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC7A4O43246 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC7A4O43246 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms