Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBDO15205 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBDO15205 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBDO15205 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBDO15205 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBDO15205 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBDO15205 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBDO15205 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms