Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB6O15197 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB6O15197 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms