Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP290O15078 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP290O15078 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEP290O15078 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEP290O15078 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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CEP290O15078 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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CEP290O15078 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP290O15078 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEP290O15078 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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CEP290O15078 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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CEP290O15078 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEP290O15078 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEP290O15078 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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