Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SETD1AO15047 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SETD1AO15047 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SETD1AO15047 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SETD1AO15047 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SETD1AO15047 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SETD1AO15047 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms