Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC80O14777 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC80O14777 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDC80O14777 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDC80O14777 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDC80O14777 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDC80O14777 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDC80O14777 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDC80O14777 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC80O14777 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC80O14777 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDC80O14777 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms