Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOCS3O14543 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOCS3O14543 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms