Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHLHE40O14503 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms