Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA3O00505 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms