Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10AO00220 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms