Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms