Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F8VRH5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F8VRH5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
F8VRH5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
F8VRH5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
F8VRH5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms