Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NACAE9PAV3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms