Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP99D6REC4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP99D6REC4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms