Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHLA1C9JL84 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms