Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM1B2RUZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms