Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CENPBD1B2RD01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPBD1B2RD01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms