Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HACD1B0YJ81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HACD1B0YJ81 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms