Protein–RNA interactions for Protein: A8MSI8

LYRM9, LYR motif-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM9A8MSI8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYRM9A8MSI8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYRM9A8MSI8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms