Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOBPA7XYQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOBPA7XYQ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
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