Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KNCNA6PVL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KNCNA6PVL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms