Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL13PA6NNM8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms