Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNF316A6NFI3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ZNF316A6NFI3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZNF316A6NFI3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms