Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6L9A6NEM1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms