Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA8A3KMH1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA8A3KMH1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms