Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPDC1A2A3K4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPDC1A2A3K4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms