Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRGMA1A4Y4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms