Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PGM1-201ENST00000371083 2657 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC016355.1-201ENST00000604760 1533 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SYTL2-201ENST00000316356 4293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PCDHGB4-201ENST00000519479 4578 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FAM157C-204ENST00000570230 2184 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AKT2-201ENST00000311278 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC022915.2-201ENST00000522575 2372 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ENO4-205ENST00000622726 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TOM1L1-213ENST00000572405 2337 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GFM2-201ENST00000296805 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MLC1-201ENST00000311597 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AP000350.2-201ENST00000439492 1763 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LINC01854-201ENST00000375987 2213 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FKBP9-212ENST00000490776 2699 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 IFNA6-201ENST00000259555 704 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC092745.1-202ENST00000539795 602 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FBXO44-206ENST00000376770 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC233701.1-201ENST00000571452 4204 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 KLF7-203ENST00000421199 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PPP1R12BP1-201ENST00000367272 1671 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 GOLGA6L5P-201ENST00000414190 2337 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 CAST-233ENST00000510756 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC068282.1-201ENST00000433673 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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LSAMPQ13449 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NPSR1-209ENST00000531252 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AL133245.1-201ENST00000608925 1365 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 EBNA1BP2-202ENST00000431635 1503 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 KCNMA1-259ENST00000639406 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF587B-203ENST00000594901 2118 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BARD1-210ENST00000613374 4096 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 ZNF543-201ENST00000321545 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 BROX-207ENST00000537020 3670 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 FCRLA-209ENST00000367957 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LSAMPQ13449 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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