Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANKRD13C-201ENST00000262346 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HSH2D-208ENST00000616645 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZNF221-202ENST00000587682 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CKMT2-AS1-201ENST00000500148 2224 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RIMS2-202ENST00000339750 3780 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NIP7-201ENST00000254940 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ADAMTS7P4-206ENST00000561209 3611 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KANK1P1-201ENST00000400619 1234 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ATP6V0CP1-201ENST00000482495 618 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC17A2-201ENST00000265425 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL138787.1-201ENST00000446354 1674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PRAMEF15-201ENST00000376152 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LMOD1-202ENST00000616739 3058 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MFSD4A-201ENST00000367147 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PSMD1-203ENST00000409643 2901 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LRRC63-202ENST00000446175 2114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CCDC38-202ENST00000546386 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 VIT-204ENST00000401530 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CDC40-202ENST00000368930 1977 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MRVI1-217ENST00000558540 3339 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL079342.3-201ENST00000624924 2061 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC016168.3-201ENST00000625040 3246 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC00551-201ENST00000607593 1668 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CAPS-203ENST00000588776 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC005837.1-201ENST00000565271 1717 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TMEM237-203ENST00000409883 5415 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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