Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP3Q9Y6F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms