Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB6Q9Y5E3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB6Q9Y5E3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms