Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KNSTRNQ9Y448 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KNSTRNQ9Y448 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms