Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFT52Q9Y366 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT52Q9Y366 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms