Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P5

SLC27A5, Bile acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A5Q9Y2P5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A5Q9Y2P5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A5Q9Y2P5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A5Q9Y2P5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A5Q9Y2P5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A5Q9Y2P5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms